Башкирия относится к числу национальных республик со сложным этническим составом. Уже это делает регион уязвимым перед зафиксированными, а также потенциально возможными проявлениями межэтнической напряженности. Башкирия, наряду с Татарстаном, традиционно упоминается экспертами как регион с наличием предпосылок к межнациональным и межконфессиональным конфликтам.
Значительным конфликтогенным потенциалом обладает проблема татаро-башкирских взаимоотношений. Татары, будучи третьим по численности – после русских и башкир – этносом республики, претендуют на расширение своих прав и периодически заявляют о притеснении башкирскими властями. Претензии татар основаны также на соседстве Башкирии с более сильным в политическом и экономическом плане Татарстаном и находят свое выражение в том числе в требовании референдума о присоединении татарских районов Башкирии к РТ. Стоит отметить, что некоторые представители Татарстана, напротив, заявляют о стремлении РБ присоединить часть татарских земель и объявить проживающих там людей башкирами.
Еще одна особенность Башкирии связана с конфессиональным составом – большинство верующих в регионе исповедует ислам. Это актуализирует угрозу распространения среди населения республики идеологии исламского фундаментализма. Пропаганде среди башкирских мусульман ваххабизма (салафии) и других радикальных течений ислама способствует значительная трудовая миграция, обусловленная привлекательностью Уфы как крупного экономического центра. По статистике, наиболее массово в Башкирию гастарбайтеры прибывают из Узбекистана, Азербайджана и Таджикистана. Рост количества мигрантов, часть из которых находится в республике нелегально, ухудшает криминогенную обстановку и является одним из факторов межэтнической напряженности, независимо от религиозной ситуации.
Тема межнациональных противоречий постоянно присутствует в публичном дискурсе. Вместе с тем в рассматриваемый период большинство зарегистрированных проявлений напряженности в Башкирии были ненасильственными. В целом ситуация носит условно стабильный характер, оснований для снижения уровня межэтнической напряженности нет. Усилия властей региона вкупе с работой правоохранительных органов пока позволяют не допустить широкого распространения радикального ислама и сохранить межэтническую напряженность в республике на прежнем уровне.